Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FARSAQ9Y285 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms