Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC8A2Q9UPR5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms