Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAL4Q9UM19 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms