Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB23Q9ULC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB23Q9ULC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms