Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PACSIN3Q9UKS6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PACSIN3Q9UKS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms