Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM4Q9UKN5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM4Q9UKN5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms