Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTBP2Q9UKA9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTBP2Q9UKA9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms