Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HERC5Q9UII4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC5Q9UII4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC5Q9UII4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms