Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTRF1LQ9UGC7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTRF1LQ9UGC7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms