Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLGN3Q9NZ94 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLGN3Q9NZ94 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms