Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM53CQ9NYF3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FAM53CQ9NYF3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM53CQ9NYF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms