Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VNN3Q9NY84 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms