Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MS4A12Q9NXJ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MS4A12Q9NXJ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms