Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HPF1Q9NWY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms