Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NDFIP2Q9NV92 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms