Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SERINC1Q9NRX5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERINC1Q9NRX5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms