Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSS2Q9NR19 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms