Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BIN3Q9NQY0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms