Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LHX9Q9NQ69 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LHX9Q9NQ69 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms