Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO1B3Q9NPD5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO1B3Q9NPD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms