Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTA1Q9NP79 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VTA1Q9NP79 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms