Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLD4Q9HCU8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLD4Q9HCU8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms