Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VAT1LQ9HCJ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAT1LQ9HCJ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms