Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC52A2Q9HAB3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC52A2Q9HAB3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC52A2Q9HAB3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms