Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD1Q9H3U5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD1Q9H3U5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms