Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPHQ9H3R5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPHQ9H3R5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPHQ9H3R5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms