Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDCBP2Q9H190 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDCBP2Q9H190 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDCBP2Q9H190 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms