Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASXL3Q9C0F0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ASXL3Q9C0F0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms