Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AMBRA1Q9C0C7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AMBRA1Q9C0C7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms