Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM8Q9BZR9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms