Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PBDC1Q9BVG4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PBDC1Q9BVG4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms