Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB2BQ9BVA1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB2BQ9BVA1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms