Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RSG1Q9BU20 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms