Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYT11Q9BT88 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT11Q9BT88 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms