Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM175Q9BSA9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms