Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NIPSNAP3BQ9BS92 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NIPSNAP3BQ9BS92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms