Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEC22CQ9BRL7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEC22CQ9BRL7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms