Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.229e-9■■■■■ 27.1
BUD13Q9BRD0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.059e-9■■■■■ 27.1
BUD13Q9BRD0 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.954e-10■■■■■ 27.1
BUD13Q9BRD0 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.084e-10■■■■■ 27.1
BUD13Q9BRD0 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 27.1
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-204ENST00000586033 545 ntTSL 523.26■■□□□ 1.314e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.956e-16■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 HEMK1-204ENST00000443894 634 ntTSL 318.29■□□□□ 0.524e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PLD2-207ENST00000574268 596 ntTSL 517.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 516.77■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 414.39□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 413.89□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PLD2-209ENST00000575246 2278 ntTSL 213.75□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PLD2-210ENST00000575316 544 ntTSL 413.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 MAP3K9-204ENST00000554146 2982 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 NADSYN1-219ENST00000531236 3429 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 MAP3K9-202ENST00000553414 3544 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PLD2-205ENST00000572940 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AC004381.2-201ENST00000637768 1329 ntBASIC10.84□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 ADD3-201ENST00000277900 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 ADD3-203ENST00000360162 3114 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 CCDC84-204ENST00000527356 1781 ntTSL 29.63□□□□□ -0.873e-9■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PLEKHA7-212ENST00000531079 589 ntTSL 47.47□□□□□ -1.218e-10■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.082e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.742e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-203ENST00000426198 885 ntTSL 224.38■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-213ENST00000497914 4360 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 SUN2-214ENST00000469086 1351 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 SUN2-216ENST00000477262 914 ntTSL 317.26■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-208ENST00000455877 591 ntTSL 415.13■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AQP1-205ENST00000482461 560 ntTSL 414.55□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-202ENST00000402306 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-209ENST00000467410 555 ntTSL 47.66□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-204ENST00000439702 592 ntTSL 47.61□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 URGCP-210ENST00000474376 399 ntTSL 23.97□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.326e-10■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 HDAC3-214ENST00000495485 797 ntTSL 310.94□□□□□ -0.666e-10■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 HDAC3-215ENST00000519474 736 ntTSL 310.78□□□□□ -0.686e-10■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 HDAC3-216ENST00000523088 699 ntTSL 38.26□□□□□ -1.096e-10■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 SREBF1-218ENST00000578469 588 ntTSL 318.03■□□□□ 0.488e-15■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PABPC4-205ENST00000421687 1663 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.562e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AGAP3-210ENST00000473140 624 ntTSL 417.35■□□□□ 0.372e-10■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 416.55■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 27
BUD13Q9BRD0 CBX2-203ENST00000571484 567 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.216e-7■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 DHX30-208ENST00000461905 591 ntTSL 221.96■■□□□ 1.111e-25■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 MTF2-207ENST00000474314 816 ntTSL 518.28■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 220.83■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.139e-8■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 MAST2-205ENST00000470809 640 ntTSL 35.74□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 ABCA7-206ENST00000525073 1918 ntTSL 222.57■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 GGA3-211ENST00000582232 598 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 26.9
BUD13Q9BRD0 TLN1-203ENST00000464379 814 ntTSL 315.15■□□□□ 0.022e-12■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 FBXO9-209ENST00000474457 2913 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.152e-13■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 SRRM1-206ENST00000466910 799 ntTSL 222.49■■□□□ 1.194e-23■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 GSN-207ENST00000432226 1042 ntTSL 520.35■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.619e-15■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.69e-15■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 FKBP4-206ENST00000543769 425 ntTSL 518.22■□□□□ 0.519e-15■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.099e-15■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 DENND5A-213ENST00000531580 564 ntTSL 412.33□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 GSN-214ENST00000485767 6454 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 DENND5A-202ENST00000524446 566 ntTSL 45.86□□□□□ -1.475e-8■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 RAB8A-207ENST00000592971 300 ntTSL 20.92□□□□□ -2.269e-15■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.751e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.631e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 SLC39A3-206ENST00000590875 572 ntTSL 223.9■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 SLC39A3-205ENST00000589363 524 ntTSL 322.4■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-202ENST00000524779 771 ntTSL 220.85■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-207ENST00000533148 1309 ntTSL 519.82■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-212ENST00000598709 747 ntTSL 517.55■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-210ENST00000534806 1033 ntTSL 516.18■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-203ENST00000525880 687 ntTSL 215.4■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-211ENST00000596093 576 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 26.8
BUD13Q9BRD0 ILVBL-206ENST00000533086 4248 ntTSL 211.72□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 609 ms