Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZSWIM1Q9BR11 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZSWIM1Q9BR11 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms