Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLF6Q99612 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF6Q99612 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms