Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT12Q99456 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT12Q99456 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms