Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSRNP1Q96S65 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSRNP1Q96S65 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSRNP1Q96S65 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms