Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GCNAQ96QF7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms