Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSPG4P5Q96PW8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms