Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GBP4Q96PP9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GBP4Q96PP9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms