Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCEEQ96PE7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCEEQ96PE7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms