Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCPIP1Q96JH7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms