Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS50Q96JG6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms