Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYFIP2Q96F07 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYFIP2Q96F07 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms