Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMIM12Q96EX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMIM12Q96EX1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms